V roku  1990 sa Karate klub Slovšport Trnava  osamostatnil od Telovýchovnej jednoty  TJ Slovšport Trnava . Ako klub   podliehal a členstvom patril do Zväzu karate SÚV  ČSZTV. V tom istom roku aj Zväz karate sa stal právnym subjektom a zmenil svoj názov na Slovenský zväz karate a iných bojových umení. V roku 1990 vytvorili niektorí funkcionári  a zástupcovia   klubov Slovenského zväzu karate novú organizáciu pod názvom Slovenská federácia karate a bojových umení. Náš klub v roku 1990 vstúpil do tejto organizácie, kde predseda nášho klubu Ing. Tibor Mikuš sa stal prezidentom tejto federácie. Klub naďalej zostal členom aj Slovenského zväzu karate a zúčastňoval sa turnajov  poriadaných týmto zväzom. Vo vnútornej štruktúre Slovenského zväzu karate  nastali rozbroje medzi funkcionármi a vedením zväzu a tak sme boli v roku 2002 vylúčený zo Slovenského zväzu karate ako organizácia disidentská ,ktorá nesmie byť členom WKC pretože ju neuznáva svetová organizácia  WKF, ktorej členom je Slovenský zväz karate.